海底小纵队是一群活跃在海底的小小冒险家。小纵队集结了皮医生（企鹅）、生物学家谢灵通（海獭）、摄像师达西西（腊肠狗）、机械工程师突突兔（兔子）、小队中尉呱唧（小猫）等7名伙伴，在核心成员巴克队长（北极熊

诺亚方舟漂流在海上，数周都看不到陆地，方舟粮食库存在不断减少，食肉动物和食草动物之间脆弱的和平随时可能被打破。芬妮和莉亚连同船上最后的食物，在一次意外中落入海里。莉亚和新朋友果冻飘到一座岛屿上，而芬妮